Urząd Skarbowy prowadzi następujące ewidencje i rejestry:

• Ewidencja podatników i płatników;
• Ewidencja zobowiązanych;
• Rejestr podatników podatku od towarów i usług;
• Rejestr wydanych zaświadczeń;
• Rejestr czynności cywilnoprawnych;
• Rejestry prowadzonych i załatwionych spraw;
• Rejestr aktów notarialnych;
• Rejestr zaewidencjonowanych kas fiskalnych;
• Rejestr kontroli podatkowych;
• Ewidencja mandatów;
• Ewidencja materiałów archiwalnych.

Podstawę oraz zasady prowadzenia przez Urząd Skarbowy rejestrów, ewidencji i archiwów regulują następujące przepisy:

• ustawa z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa;
• ustawa z dnia 13 października 1995 r. o zasadach ewidencji i identyfikacji podatników i płatników;
• Zarządzenie Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 28 lutego 2017 r. w sprawie wprowadzenia instrukcji kancelaryjnej izb administracji skarbowej, urzędów skarbowych i urzędów celno-skarbowych oraz instrukcji w sprawie organizacji i zakresu działania archiwum zakładowego izb administracji skarbowej;
• Zarządzenie Ministra Rozwoju i Finansów z dnia 28 lutego 2017 r. w sprawie wprowadzenia jednolitego rzeczowego wykazu akt w izbach administracji skarbowej, urzędach skarbowych i urzędach celno-skarbowych;
• zarządzenie Nr 37/2012 Ministra Finansów z dnia 14 sierpnia 2012 r. w sprawie postępowania w przypadku zaskarżenia do sądu administracyjnego decyzji, postanowienia lub innego aktu albo czynności z zakresu administracji publicznej oraz rejestrów prowadzonych w tych sprawach ze zmianami;
• ustawa z dnia 29 września 1994 r. o rachunkowości;
• ustawa z dnia 5 sierpnia 2010 r. o ochronie informacji niejawnych;
• regulamin organizacyjny urzędu skarbowego.